在如何处理徐锡麟的问题上，清廷参照了了当年“刺马案”张汶祥暗杀两江总督马新贻的先例。当年张汶祥所受的是剖挖心脏之刑，新任安徽巡抚冯煦请示两江总督端方后，决定仿行。行刑之日，先由刽子手持铁锤将徐锡麟的睾丸砸烂，再剖腹取出心脏，这颗心脏被拿去祭祀恩铭的“在天之灵”，然后被恩铭的亲兵们烹熟下酒。清廷此时正在实施法律制度的近代化转型，却不惜逆流而动，以如此残忍的手段杀害徐锡麟，更坐实了革命党对其“假立宪、假改革”的指控。